1、东莞无尘车间的清扫一般须在生产工艺结束后进行；如有必要在生产前清扫，则工艺生产必须在净化空调系统开机运行时间达到洁净要求后方可开始进行。为防止交叉污染，清扫洁净厂房设施均应按产品特点、工序要求、洁净度等级不同分别专用。 清扫工具一般采用集中固定式和便携移动式真空清扫设备。如不具备上述条件，也可采用不掉纤维的材料如丝光毛巾、尼龙布进行擦拭，一般每天1次或数次。 工作台及工器具清扫一般每天一次；10～1000级厂房墙壁、地面清扫，一般每周一次，1万～10万级每月一次。净化空调系统每年宜清洗1～2次，并委托专门清扫人员进行。 2、洁净室灭菌 对生物洁净室，除对送入洁净室的空气中的生物或非生物微粒数要受到控制，还要对室内器具、地面、墙面、壁板等表面进行消毒处理。空气洁净技术不能杀灭细菌，生物洁净室运行管理中必须采取消毒、灭菌措施，减少微生物在洁净室中的生存、繁衍。 目前，传统灭菌方法为：紫外线灭菌、药剂灭菌、加热灭菌和臭氧灭菌法。它们安全可靠性都很好，应用 为广泛。 另外，整个被消毒灭菌的洁净室应通过送回风管形成循环状态，每天开机做空气灭菌1—1.5小时;若需对洁净室墙体、地面和设备等表面进行消毒灭菌则需2小时左右。

东莞无尘车间（区）的压差控制是确保其稳定正常运行和防止交叉污染的主要条件，作出相关规定的依据和实施中应关注的事项说明如下供参考。 压差值的确定，为了保证100级无尘车间在正常工作或空气平衡暂时受到破坏时，气流都能从空气洁净度高的区域流向空气洁净度低的区域，使无尘车间的洁净度不会受到污染空气的干扰，所以东莞无尘车间必须保持一定的压差。在国内外无尘车间标准和洁净度等级中对无尘车间内压差值的大小都做了明确的规定。压差值的大小应选择适当。压差值选择过小，无尘车间的压差很容易破坏，无尘车间的洁净度就会受到影响。压差值选择过大，就会使净化空调系统的新风量增大，空调负荷增加，同时使中效、高效过滤器使用寿命缩短。另外，当室内压差值高于50Pa时，门的开关就会受到影响。因此，东莞无尘车间压差值的大小应根据我国现有无尘车间的建设经验，参照国内外有关标准和试验研究的结果合理地确定。